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单细胞分析确定小儿血液疾病的体细胞遗传拯救

单细胞DNA分析发现儿科骨髓增生异常综合征(MDS)患者体内存在“克隆之战”,这些患者的细胞可能会自我纠正。由圣裘德儿童研究医院牵头的国际合作,通过欧洲儿童MDS工作组涉及数十家机构的学者,利用单细胞DNA分析来探索儿科患者的体细胞遗传拯救(SGR)现象。MDS。

这项工作发表在《自然医学》杂志上的论文《SAMD9/SAMD9L综合征中的临床进化、遗传景观和克隆造血轨迹》中。”

SGR是一种罕见的自发事件,其中给定细胞中发生体细胞突变,有时抵消致病性种系突变的影响。MarcinWlodarski博士和他的合作者研究了SGR在患有MDS的儿童中的作用,MDS是一种血癌,骨髓无法产生足够的健康血细胞。

与患这种疾病的成年人不同,如果儿童出生时携带SAMD9和SAMD9L(SAMD9/9Lmut)特定种系突变,则他们可能容易患MDS。然而,此漏洞的原因尚不清楚。

在这项研究中,研究人员调查了一个临床注释的儿科MDS队列(n =669),以定义“SAMD9/9L综合征的患病率、遗传景观、表型、治疗结果和克隆结构”。

一些研究结果包括,在连续诊断的MDS中,种系SAMD9/9L突变占8%,并且与7%的队列中存在的GATA2突变相互排斥。此外,在SAMD9/9L突变病例中,难治性血细胞减少症是最常见的MDS亚型(90%);获得性7号单体占38%;57%的人发现体质异常;28%的人存在免疫功能障碍。此外,临床结果与种系突变无关。

通过使用MissionBio的Tapestri平台的单细胞分析技术,研究人员发现,三分之二的患有SAMD9/L突变的儿童会发生SGR事件,这些事件会阻止突变基因的表达,包括一些恢复正常血液的基因发展。重要的是,这些数据表明携带种系SAMD9/9L突变的儿科患者可以自我纠正,而无需进行侵入性骨髓移植。

“单细胞分析使得识别患者体内同时发生的多个救援克隆成为可能,包括作为一种自然基因治疗形式发挥作用的体细胞遗传事件,揭示了这些事件的全部遗传复杂性,”SushreeSahoo博士说,圣裘德儿童研究医院博士后研究员。“通过单细胞分析,我们能够看到这些事件的完整遗传复杂性。事实证明,携带SAMD9和SAMD9L突变的MDS患者面临着一个克隆战场:导致良性或高风险白血病改变的不同遗传事件正在争夺血液系统中的主导地位。如果临床医生在患者身上发现这些克隆,他们可能会选择推迟或推迟骨髓移植,看看自然基因疗法是否会胜出。”

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